No segundo semestre de 2009 já era o melhor jogador do campeonato nacional, conseguindo chegar a disputar o Brasileirão e 💴 o Campeonato Brasileiro.
No final daquele ano o time teve que abandonar o futebol profissional no início de 2010 Em 2012 💴 o clube passou mal e acabou sendo rebaixado para a Série C do Brasileirão, onde o time ficou até 2016, 💴 Durante a Série C de 2015 o clube foi promovido do hexagonal final para a Série A3,
onde ficou até 2017, 💴 Depois de uma boa campanha no campeonato 2011 o time não participou do campeonato e, junto com o Santa Cruz, 💴 foi rebaixado para a Série B no ano seguinte.
Em 2013 o Santa Cruz participou da segunda divisão do campeonato de 💴 2014, além de ter que disputar uma competição de playoffs.
Em 2015 o Santa Cruz acabou sendo rebaixado para a Série 💴 A2.