Enquanto em modo Puzzle, você pode se habilitar uma pessoa usando o equipamento como visto anteriormente.
O modo Puzzle foi inicialmente 🧬 disponível para a série "Sonic Adventure, mas isso pode ser trocado em qualquer momento.
Quando você habilitou um usuário para o 🧬 modo, ela pode ser desbloqueada a qualquer momento, mesmo que ela não esteja habilitado para continuar o jogo.
No modo Puzzle, 🧬 os inimigos e obstáculos de "Sonic Gems" são representados visualmente no mapa, bem como a própria história
em várias cutscenes.